TMPRSS2:ERG融合基因与前列腺癌之间的关联:系统评价和荟萃分析
作者:Herney Andreacute;s Garciacute;a-Perdomo1, Maria Juliana Chaves1, Julio Cesar Osorio1, Adalberto Sanchez2
单位:1 UROGIV Research Group, Universidad del Valle, Cali, Colombia;
2 LABIOMOL Research Group, Universidad del Valle, Cali, Colombia
引言:探讨TMPRSS2:ERG融合基因及其变异与局限性前列腺癌发病的关系。
材料和方法:通过MEDLINE、EMBASE、LILACS、CENTRAL和未公开的文献进行系统的搜索。 我们纳入年龄在18岁以上患者的随机对照试验、队列研究、病例对照研究和横断面研究,评估TMPRSS2融合基因其单核苷酸多态性与前列腺癌之间的关系。主要结局是根据经直肠超声引导下的活检、经尿道前列腺电切术或前列腺癌根治术的肿瘤组织学定义的前列腺癌。我们使用QUADAS2评估偏倚的风险,并使用Stata14进行荟萃分析。
结果:通过检索策略共找到241条记录。去重后,纳入定性分析研究18项,纳入荟萃分析研究15项。所有入选的研究都没有适用性问题,流量和时序的偏倚风险低。其中9项研究因为没有恰当地描述盲法评估,所以对指数和参考测试有不明确的偏倚风险。关于TMPRSS2:ERG和前列腺癌之间的联系,我们发现OR为2.24,95%置信区间为(1.29-3.91)。关于使用不同样本类型进行融合基因与前列腺癌之间的关联性分析发现,尿液OR为2.79,95%置信区间为(1.12-6.98),当使用DNA分子模板时,OR为3.55,95%置信区间为(1.08-11.65)。
结论:TMPRSS2:ERG融合基因与前列腺癌的诊断有关,主要存在于尿液样本和基于DNA的分子模板中。TMPRSS2:ERG可以用作前列腺癌诊断和分层的金标准。
关键词:基因;荟萃分析;前列腺癌;TMPRSS2:ERG
引言:
前列腺癌(prostate cancer,PCa)是一种异质性疾病,具有可变的自然病史和缓慢的生长方式。 它可能会显示长达20年的潜伏期,在此期间内它始终保持器官受限。 尽管PCa病变可以长期定位,但可能会出现更具侵略性的形式,并且在发生转移时,淋巴结和骨骼受累的主要结果一般是有害的[1]。 PCa是全球男性(主要是gt; 65岁)中第二常见的癌症。 这是发达国家的一个公共卫生问题,其中老年男性占总人口的比例最大[2]。
PCa的高危人群和易感患者需要长期筛查。年龄、种族和家族史是最重要的危险因素[3]。同卵双胞胎的风险比异卵双胞胎高50%,非裔美国人的发病率较高(亚裔美国人的发病率较低),这表明遗传因素是人口水平变异风险的重要决定因素[4]。由于缺乏特异性标志物,人们对该病的诊断和早期治疗一直存在担忧[5]。到目前为止,PCa诊断的金标准是包括前列腺的组织病理学评估在内的一种侵入性的方法,这是一种检出率很高的方法[6]。
目前,使用前列腺特异性抗原(prostate specific antigen, PSA)作为前列腺癌的筛查和监测标志已广泛使用,并且是目前唯一广泛使用的PCa血清生物标志物[7],但是在普通人群中对男性PCa的筛查仍有争议。这种生物标志物是前列腺特异性的,但它的特异性较低,还会增加不必要的活检,而不会降低死亡率[8]。
自2005年以来,跨膜蛋白酶丝氨酸2:vets成红细胞病病毒E26癌基因同源物(TMPRSS2:ERG)基因融合被评估为PCa的特定生物标志物[9]。 这种跨膜蛋白酶丝氨酸2(TMPRSS2)位于21q22.2,并在正常和恶性前列腺上皮中表达,被认为是一种有应用前景的生物标志物。 此外,ERG是E-26家族成员(ETS)的成员,该家族成员是分化、凋亡、胚胎发育、细胞增殖和炎症的关键调节因子。
当前,有各种研究试图寻找该基因融合蛋白与晚期前列腺癌之间的关联,但对该基因作为诊断工具的研究较少[10]。
这项研究的主要目的是确定TMPRSS2:ERG融合基因及其变异体与局限性前列腺癌的发生之间的关联。
1.材料和方法
我们根据Cochrane组织[11]的建议并遵循PRISMA声明[12]进行了此项评价。PROSPERO注册号为CRD42018087071。
1.1合格标准
我们纳入了年龄在18岁以上的患者的随机对照试验(RCT)、队列研究、病例对照研究和横断面研究,评估TMPRSS2融合基因其单核苷酸多态性(SNP)与PCa之间的关联。 还包括分子生物学,转化和临床研究以及比较患有前列腺癌的男性和未患有前列腺癌的男性的研究。 我们排除了观察性描述性研究,无人类受试者和晚期前列腺癌的研究。没有设置语言限制。
1.2TMPRSS2及相关SNPs
我们之前在Emsemble中进行了检索。 然后鉴定了相关基因并选择了人类TMPRSS2变异体。在Genecards.org应用了选定的基因并鉴定了相关的表型,此外还在《京都基因和基因组百科全书(KEGG)》中鉴定了PCa的超路径,并在加州大学圣克鲁斯分校(UCSC)人类基因组浏览器(GRCh38/hg38)组件中进行了最终检索。最后,我们发现以下SNP在转录成蛋白质时可能是一个错义变体:rs572530227,rs537370123,rs570454392,rs545726689,rs185312677,rs540987630,rs546335233,rs561063944,rs147233451,rs544474510,rs565237319 rsrs414414037 rs12329760,rs75603675。
主要结果:经直肠超声引导下(TRUS)活检、经尿道前列腺电切术(TURP)或根治性前列腺切除术的肿瘤组织学定义为前列腺癌。
1.3信息来源
根据Cochrane建议进行文献检索。使用了医学主题词(MeSh)、Emtree语言、健康科学描述符(Decs)和相关的文字。从开始到2018年2月,我们从Medline (OVID)、EMBASE、LILACS和Cochrane中央对照试验登记册(Central)(附录1)中进行检索。为了确保文献饱和,我们扫描了通过检索、会议、论文数据库、开放灰色、谷歌学术和clinicaltrials.gov等确定的相关文章的参考文献。我们试图通过电子邮件联系作者,以防信息丢失。此外,我们在以下特定数据库中寻找信息:单核苷酸多态性数据库(dbSNP)、GeneSNP、Polyphen、人类基因组数据库、Ensemble等。
1.4数据采集
两名研究人员按标题和摘要对每篇参考文献进行审查。然后扫描相关研究全文,应用预先指定的纳入和排除标准提取数据。如遇分歧,则通过协商解决,如果分歧不能解决,第三位审查员进行调解。
两名训练有素的审查员使用标准化形式独立地从每篇文章中提取以下信息:研究设计类型、国家、作者姓名、标题、目标、纳入和排除标准、纳入的患者数量、失访、时间、结局的定义、结果和关联措施以及资金来源。
1.5偏倚风险
根据Cochrane的建议,使用QUADAS2工具评估每项研究的偏倚风险[13]。
1.6数据分析/结果综合
使用Stata 14reg;和Review Manager 5.3(Revmanreg;5.3)进行统计分析。对于分类结果,报告有关优势比(OR)的信息,根据变量的类型具有95%的置信区间,并且根据预期的异质性对这些信息进行了随机效应荟萃分析。在森林图中报告的结果以95%的可信区间(95%可信区间)估计了纳入研究的效果。异质性评价采用I2检验。为方便解释,将I2测试中25%、50%和75%的值分别定义为于低、中和高水平的异质性。
1.7发表偏倚
使用漏斗图进行评估,以确定报道或发表偏倚
表1纳入研究特点
作者 |
基因 |
技术 |
分子模板 |
样本 |
国家 |
年龄 |
研究设计 |
样本量 |
Penney2016 |
TMPRSS2:ERG |
免疫组化x微阵列 |
蛋白质 |
组织 |
美国 |
40–84 |
队列研究 |
487 |
Sanda 2015 |
TMPRSS2:ERG |
mRNA |
RNA |
尿液 |
美国 |
55–60 |
前瞻性多中心研究 |
1077(516) |
Park 2014 |
TMPRSS2:ERG |
免疫组化x单克隆抗体 |
蛋白质 |
组织 |
美国 |
中位数为65 |
随机、双盲、安慰剂对照的III期临床试验 |
1590(461) |
Tavukcu 2013 |
TMPRSS2:ERG |
RT-PCR |
RNA |
组织,外周血 尿液,阴毛 |
土耳其 |
43–78 |
队列研究 |
50 |
Lin 2013 |
TMPRSS2:ERG |
RT-PCR |
RNA |
尿液 |
美国 |
NA |
前瞻性、观察性、主动监测研究 |
387 |
Leyten 2012 |
TMPRSS2:ERG |
mRNA |
RNA |
尿液 |
荷兰 |
44–86 |
前瞻性多中心队列 |
443 |
Tomlins 2011 |
TMPRSS2:ERG |
转录介导扩增(恶性)/荧光原位杂交(良性) |
RNA/DNA |
尿液(恶性)/组织(良性) |
美国/加拿大 |
56–65 |
队列研究 |
1312 |
Mosquera2009 |
TMPRSS2:ERG |
FISH |
DNA |
组织 |
美国 |
54-70 |
队列研究 |
140(134) |
Laxman 2008 |
TMPRSS2:ERG |
RT-PCR |
RNA <!--剩余内容已隐藏,支付完成后下载完整资料
英语原文共 10 页,剩余内容已隐藏,支付完成后下载完整资料 资料编号:[270756],资料为PDF文档或Word文档,PDF文档可免费转换为Word |
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